Diverse desinfectiemiddelen zijn werkzaam tegen het MKZ-virus. De overheid heeft een aantal middelen toegelaten voor reiniging en ontsmetting van veewagens. Afhankelijk van de samenstelling zijn een aantal middelen werkzaam tegen bacteriën en virussen. De middelen waarvan de fabrikant aangeeft dat ze ook tegen MKZ werken, zijn dus bruikbaar bij de preventie.

Beschikbare middelen
In het MKZ-draaiboek van de overheid staat als desinfectiemiddel alleen citroenzuur (2%) genoemd. Op het moment dat het draaiboek in werking treedt, zal de RVV dus citroenzuur gaan voorschrijven. Tot dat moment kan een varkenshouder of transporteur een "veewagen-desinfectiemiddel" gebruiken. Een voordeel daarvan is dat die middelen ook werken tegen andere virussen en bacteriën. Citroenzuur werkt uitsluitend tegen enkele zuur-gevoelige virussen, zoals mond- en klauwzeer. Zie ook: Desinfectiemiddelen voor veewagens

Desinfecteren
Desinfectie kan een goed wapen zijn tegen besmetting. Bedenk bij desinfectie echter wel altijd dat:

• vuile oppervlakken ontsmetten onmogelijk is. Eerst reinigen is dus van groot belang;
• minimaal 5 minuten contacttijd nodig is voor een enigszins aanvaardbaar resultaat (zie voorschrift fabrikant);
• bij koude de benodigde contacttijd alleen maar toeneemt;
• reinigingswater en regen de oplossing sterk kunnen verdunnen;
• de oplossing minstens 2x per week ververst moet worden (ook als deze nog schoon is);
• de oplossing direct ververst moet worden als deze vervuild is;
• diverse middelen mengen de werking kan verminderen;
• de persoonlijke veiligheid niet moet worden vergeten;
• sterk bijtende middelen materialen kunnen aantasten;
• nooit alle ziekteverwekkers worden gedood, en dat er na desinfectie dus een risico van ziekte-insleep blijft bestaan!